طبق نتایج منتشر شده توسط ISC، دانشگاه فردوسی مشهد در ارزیابی سال 99- 1398، در بازه رتبه‌ای 10-1 دانشگاه‌های‌ جامع وزارت علوم، تحقیقات و فناوری قرار گرفت. به گزارش معاونت برنامه ریزی و توسعه منابع دانشگاه، در رتبه‌بندی جدید با توجه به نزدیک بودن امتیازات دانشگاه‌ها، انتخاب بازه‌های رتبه‌ای به جای رتبه مطلق در اعلام نتایج مد نظر قرار گرفته است. همچنین معیارهای رتبه‌بندی از پنج معیار به شش معیار شامل آموزش (با وزن 30 درصد)، پژوهش (با وزن 25 درصد)، فناوری و نوآوری (با وزن 20 درصد)،